南红玛瑙因产地不同，在市场上的红色玛瑙除了有南红以外，还有很多烧色的红玛瑙和人工合成的红色玻璃来冒充的玛瑙，准确区分这些仿冒品在选购南红玛瑙时十分重要。在选购玛瑙时，可以从其颜色、纹理、透明度、材质和温度这五个部分来进行辨别。
颜色：南红玛瑙的颜色十分自然，色泽鲜润具活性感、纯正、厚重、协调，而烧色玛瑙和红色玻璃的颜色往往十分不自然，而且往往艳丽轻浮。此外，烧色玛瑙的颜色还会偏向红棕色。
纹理：南红玛瑙的纹路比较清晰 ，在纹路中间也没有粉末状或者是一些杂色，但是假的南红玛瑙就会在裂纹处出现一些火烧的痕迹，这其实还是比较容易看出来的。另外，南红玛瑙在时间的推移之下会产生风化的情况，从而产生月牙状的风化纹。但是假的就不会有。
透明度：南红玛瑙的透明度并不高，大多是不透明的，有的能看见自然水线或“云彩”或“丝絮”状结构，是一种胶状的形态，就算是无色的南红玛瑙也不会很透明，会有着一层朦胧感。而烧色玛瑙和合成玻璃的透明度都十分优秀，有的甚至完全透明，十分不自然。
材质：南红玛瑙的结果一般较为紧密、结实，多数非酸碱影响的玛瑙利茬可在玻璃板上划出划痕来，而有些冲压而成的仿冒南红质地十分松散，材质易碎且轻。
温度：天然的南红玛瑙有凉感，而人工合成的玛瑙随外界温度的变化而变化。